qPCR効率計算機

qPCRにおける増幅効率とは？

リアルタイムPCR（定量PCR）において、DNAが1サイクルごとに正確に2倍に増えるのが理想的な状態です。これを効率100%と呼びます。しかし、プライマーの設計、阻害物質の混入、試薬の状態などにより、実際の効率は変動します。

計算式

増幅効率は、検量線（Standard Curve）の傾き（Slope）から以下の式で求められます。

また、増幅率（Amplification Factor）は 10^(-1/Slope) です。理想的な場合は 2.00 になります。

適正範囲とトラブルシューティング

• 90% - 110% (Slope: -3.58 〜 -3.10): 良好。信頼できるデータです。
• > 110% (Slope > -3.10): 不良。プライマーダイマーの形成や阻害物質の影響が考えられます。ピペッティングエラーの可能性もあります。
• < 90% (Slope < -3.58): 低効率。プライマーの設計不良、反応条件の不最適化などが疑われます。

Slopeの目安

• -3.32 : 効率 100% (理想)
• -3.10 : 効率 約110%
• -3.58 : 効率 約90%